Рентна плата за спеціальне використання води обчислюється з фактичних обсягів використаної підземної та поверхневої води з урахуванням лімітів, встановлених у дозволі на спеціальне водокористування або в інтегрованому довкіллєвому дозволі, а також ставок рентної плати і відповідних коефіцієнтів. Якщо вода використовується зі змішаного джерела, рентна плата розраховується пропорційно часткам води з кожного джерела. При використанні води з каналів плата визначається за обсягами фактично використаної води з урахуванням лімітів, ставок та коефіцієнтів, встановлених для водного об’єкта, з якого подається вода в канал.
За відсутності дозволу на спеціальне водокористування або інтегрованого довкіллєвого дозволу з установленими лімітами рентна плата справляється за весь обсяг використаної води як за понадлімітне використання. Плата за понадлімітне використання води обчислюється окремо за кожним джерелом водопостачання.
Спеціальне водокористування є платним і здійснюється на підставі дозволу, у якому встановлюються ліміти забору та використання води, а також скидання забруднюючих речовин. Водночас законодавством запроваджено інтегрований довкіллєвий дозвіл, який може замінювати дозвіл на спеціальне водокористування. За наявності такого дозволу окремий дозвіл на спеціальне водокористування не потрібен, а на водокористувачів поширюються загальні вимоги щодо спеціального водокористування.
Строк дії дозвільних документів, зокрема дозволів на спеціальне водокористування, які закінчилися в період дії воєнного стану, вважається продовженим на весь період воєнного стану та до кінця календарного року, в якому його припинено або скасовано, але не менше ніж на три місяці після його завершення. У зв’язку з цим спеціальне водокористування в межах лімітів, встановлених такими дозволами, не вважається понадлімітним.